针对废纸回收利用过程中经济与生态环境之间的矛盾,以物质流为载体,构建废纸回收利用体系的价值流.在此基础上,界定了废纸回收利用体系生态成本的内涵,并建立其生态成本核算模型.以废纸回收利用体系生态成本最小为目标函数,以经济效益、生产工艺条件、国家政策和行业标准为约束条件,进行优化设计.结果表明,优化后生态成本为1385.69元/t,与优化前相比下降了456.8元/t,降幅达24.79％;经济效益增加到1326.95元/t,比优化前提高了13.51％.建议加强废纸回收打包企业集约化发展,提高大型打包厂比例;适当控制废纸价格,避免废纸价格过高;国家对废纸回收利用企业进行适度经济补偿,将有助于废纸回收利用体系的经济发展与生态环境的双赢.