根系是作物获取水分和养分的重要器官，由于土壤的观测阻碍，根系三维形态的认知与表达成为作物根系深入研究的瓶颈。三维数字化、可视化是研究和认知作物形态结构的重要方法，研究具有表征根系长相长势及土壤中水分、养分等物质对作物根系构型的影响具有重要意义。本文从三维角度，综述了近年来作物根系构型探测手段、三维重构与可视化方面的研究进展。首先从破坏性探测与原位探测两方面介绍了近年来根系构型三维探测的方法。破坏性探测主要包括直接挖掘法、土块保护挖掘清洗法和平板扫描图像分析法，破坏性探测方法在获取全局或局部根系拓扑结构与平面几何构型参数方面具有较大优势；原位探测方法主要包括土壤中安置观察装置法、地面穿透雷达法、特殊培养环境法、CCD　相机法、三维数字化方法及穿透射线成像法等，作物根系的原位探测保持了根系构型的空间分布信息，但大部分方法仅能针对作物生长初期或可控生长环境下的作物根系开展数据获取。由于作物根系探测数据大多以局部二维图像形式存在，文章综述了基于二维图像的作物根系平面几何构型解析的相关内容，包括基于二维图像的根系识别与参数提取的算法与相关软件。分析表明，目前作物根系数据获取仍存在：（1）数据获取费时费力；（2）方法局限性大；（3）数据完整性低；（4）各种方法所获取数据融合应用度低等问题。在根系探测的基础上，从三维建模与生长建模两方面介绍了作物根系三维建模与可视化方面的相关工作。其中，根系三维建模包括了基于模拟算法的几何建模和基于原位探测的三维重建两部分，基于模拟算法的几何建模是在人们对作物根系认识的基础上，结合计算机模拟算法，构建与实际根系具有形态相似性的根系三维几何模型；与之相比，基于原位探测的三维重建更能真实地反映作物根系的实际形态，其主要包括　XCT、三维数字化等方法。最后，文章展望了数据缺失条件下的作物根系三维重建研究，认为在目前技术手段前提下，已可实现根系拓扑结构三维解析，但根系的空间分布重建难度较大，尤其是在大田环境下作物根系原位测量的前提下；此外，目前作物根系三维数据主要存在着数据缺失、各种数据各为己用等问题，认为有必要将小子样理论与数据融合相关方法引入到作物根系三维重建研究，实现缺失数据条件下有效利用多种数据获取手段的作物根系三维重建。