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蛋白质相互作用(Protein-protein interaction, PPI)网络是生命活动中一种极其重要的生物分子关系网络,利用计算方法从PPI 网络中检测功能模块是目前生物信息学中一项重要的研究课题。本文首先总结了功能模块检测过程的基本流程,说明了预处理和后处理的作用；其次,提出了一种模块检测方法的分类体系,并对其中一些代表性的检测算法进行了阐述；再次,给出了模块检测常用的数据库、评价指标和相关软件工具,并通过实验对代表性算法进行了性能对比。最后,通过对该领域挑战性问题的分析预测了模块检测未来的研究方向,以期对相关研究提供一定的参考。
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Source ：
自动化学报
ISSN： 0254-4156
Year： 2014
Issue： 4
Page： 577-593
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