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王学栋 (王学栋.) | 尚文慧 (尚文慧.) | 李晓琴 (李晓琴.) | 常宇 (常宇.)

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摘要:

甲基化异常是肿瘤早期的频发事件,DNA甲基化随着时间的推移相对稳定,并且可以在血液中非侵入性地检测到,因此DNA甲基化具有成为癌症早期诊断生物标志物的巨大潜力.为了找到肺鳞状细胞癌(LUSC)潜在的诊断标志物,本文提出了一种LUSC特异性候选诊断标志物的识别方法,使用癌症基因组图谱数据库(TCGA)的LUSC的甲基化数据集,通过比较LUSC与正常肺组织和其他癌症类型,得到了6个LUSC特异性甲基化位点,使用支持向量机建立诊断模型,采用六折交叉划分数据集,验证特异性标志物的有效性.6个标志物的组合在预测LUSC方面达到约93%~99%的灵敏度,在排除正常组织时达到100%的特异性,在排除其他癌症时达到约99%的特异性.我们的研究为LUSC的早期诊断提供了潜在的生物标志物.

关键词:

特异性标志物 DNA甲基化 肺鳞状细胞癌 早期诊断

作者机构:

  • [ 1 ] [王学栋]北京工业大学
  • [ 2 ] [尚文慧]北京工业大学
  • [ 3 ] [李晓琴]北京工业大学
  • [ 4 ] [常宇]北京工业大学

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来源 :

生物化学与生物物理进展

ISSN: 1000-3282

年份: 2019

期: 7

卷: 46

页码: 680-688

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