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作者:

肖行行 (肖行行.) | 冀俊忠 (冀俊忠.) (学者:冀俊忠) | 杨翠翠 (杨翠翠.)

收录:

CQVIP PKU CSCD

摘要:

针对群智能聚类方法在蛋白质相互作用网络功能模块检测问题上运行时间长的不足,本文提出了一种基于烟花算法的蛋白质相互作用网络功能模块检测方法(Fireworks Algorithm for Functional Module Detection in Protein-protein Interaction Networks,简称FWA-FMD).首先结合蛋白质相互作用网络的拓扑结构信息和基因本体的功能注释信息,基于标签传播思想将每个烟花个体初始化为一种候选的功能模块划分.其次在每一代进化过程中,利用具有局部搜索和全局搜索自调整能力的爆炸操作对每个烟花个体进行优化,并同时采用精英保留和轮盘赌策略选择...

关键词:

功能模块检测 标签传播 烟花算法 爆炸操作 蛋白质相互作用网络

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学信息学部
  • [ 2 ] 多媒体与智能软件技术北京市重点实验室(北京工业大学)

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来源 :

哈尔滨工业大学学报

年份: 2019

期: 05

卷: 51

页码: 57-66

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