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冀俊忠 (冀俊忠.) (学者:冀俊忠) | 杨明浩 (杨明浩.) | 杨翠翠 (杨翠翠.) | 韩跃 (韩跃.)

收录:

CQVIP PKU CSCD

摘要:

针对蚁群聚类在蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络中进行功能模块检测问题上时间性能的不足,提出一种快速的基于蚁群聚类的PPI网络功能模块检测(fast ant colony clustering for functional module detection,FACC-FMD)方法.该算法计算每个蛋白质与核心组蛋白质的相似度,根据拾起放下模型进行聚类,得到的初始聚类结果中功能模块之间相似度很小,省去了原始蚁群聚类算法中的合并和过滤操作,缩短了求解时间.同时该算法根据蛋白质的关键性对蚁群聚类中的拾起放下操作做了更严格的约束,以减少拾起放下的次数,加...

关键词:

关键蛋白质 功能模块检测 核心组蛋白质 蚁群聚类 蛋白质相互作用网络

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室

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来源 :

北京工业大学学报

年份: 2016

期: 08

卷: 42

页码: 1182-1192

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