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作者:

李晓琴 (李晓琴.) | 张春城 (张春城.)

收录:

CQVIP PKU CSCD

摘要:

针对折叠类型分类中所选天然模板普适性不足的问题,提出了Bromodomain-like折叠类型模板的设计方法.选SCOPe Astral 2.03序列相似度小于40%并且分辨率高于0.25 nm的52个可用Bromodomain-like折叠样本,基于多结构比对结果及数据分析,建立了折叠类型家族模板的设计方法.利用系统聚类方法构建了家族模板的系统聚类图,提出了蛋白质折叠类型模板的设计方法,并用于该折叠类型的模板设计.结果表明:设计模板具有普适性,可用于蛋白质折叠类型分类.

关键词:

折叠类型分类 模板设计 系统聚类 结构比对

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学生命科学与生物工程学院

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来源 :

北京工业大学学报

年份: 2016

期: 10

卷: 42

页码: 1572-1580

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