近期,氨氧化古菌(ammonia-oxidizing　archaea,AOA)在各类环境中的发现,打破了人们原来认为氨氧化主要是由氨氧化细菌(ammonia-oxidizing　bacteria,AOB)完成的观点.但是在全程自养脱氮(　completely　autotrophic　nitrogen　removal　over　nitrite,　CANON)污水处理系统中关于　AOA　的研究却鲜有提及.利用　PCR、克隆、实时荧光定量　PCR(quantitative　real　time　PCR,qPCR)等分子生物学技术,对1个小试(lab-scale,L)和1个中试(pilot-scale,P)　CANON　系统中的生物膜和活性污泥絮体两种形态的污泥进行　AOA　数量和种属特征的研究.结果表明：①系统　L　和　P　中,AOA　的　amoA　基因数量平均值(以　dry　sludge　计)分别为2.42×106　copies·g　-1和6.51×106　copies·g　-1；②　AOA　的　amoA　基因丰度随污泥形态不同数量相差很大：L　系统中,生物膜　AOA　amoA丰度约为活性污泥絮体的11.1~15.1倍；　P　系统中,污泥絮体　AOA　amoA　数量是生物膜中的2.8倍；③多样性方面：P　系统的AOA　多样性较低,仅出现一个　OTU,该　OTU　属于　Nitrosopumilus　subcluster　5.2类群；　L　系统　AOA　多样性较高,共有8个　OTU　出现,分别属于　Nitrososphaera　subcluster　9、　subcluster　8.1、　subcluster　4.1、　subcluster　1.1和　Nitrosopumilus　subcluster　5.2这5个类群.总之,在同一个　CANON　系统中,污泥形态不同,AOA　的丰度和群落结构相差较大；　AOA　可能发挥着氨氧化的作用.