We　report　a　120　W　high　average　power　all-fiber　subnanosecond　master　oscillator　power　amplifier　(MOPA)　system　with　a　two-stage　amplifier　chain.　The　seed　source　is　an　ytterbium-doped　single　mode　fiber　laser　passively　mode-locked　by　nonlinear　polarization　rotation　(NPR).　Its　pulse　width　is　tunable　from　0.59　ns　to　1.2　ns　by　changing　the　length　of　the　laser　cavity.　The　average　output　power　of　91.5　mW　is　obtained　at　26.3　MHz　with　pulse　width　of　0.59　ns.　A　large　mode　area　double　cladding　high-absorption　ytterbium-doped　fiber　is　introduced　into　the　master　power　amplifier　to　suppress　the　nonlinear　effects.　Finally,　120　W　average　output　power　is　obtained　with　single　pulse　energy　of　4.56　mu　J,　and　its　optical-to-optical　conversion　efficiency　is　up　to　83.9%.　In　addition,　we　demonstrate　19.5　W　average-power　supercontinuum　generation　in　photonic　crystal　fiber　(PCF)　using　this　subnanosecond　pulsed　fiber　amplifier.