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宋新蕊 (宋新蕊.) | 李晓琴 (李晓琴.)

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摘要:

蛋白质分子进化规律研究是分子进化研究的重点,对揭示生命起源与进化机制有重要意义.本文对已知空间结构及物种信息的单绕蛋白,利用结构比对信息,构建了不同层次单绕样本系统聚类图.分析发现:功能相似蛋白存在明显聚集现象,同一超家族样本基本聚在一个大支中,同一家族样本集中在所属超家族下的小支中,功能约束下单绕样本聚类图与物种进化图有较好对应关系.结果表明:单绕蛋白的结构演化反映了蛋白质功能的约束,特定功能单绕样本的结构差异具有种属特异性,结构演化包含了物种进化信息.

关键词:

结构比对 单绕 系统聚类 物种进化

作者机构:

  • [ 1 ] [宋新蕊]北京工业大学
  • [ 2 ] [李晓琴]北京工业大学

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来源 :

生物信息学

ISSN: 1672-5565

年份: 2013

期: 1

卷: 11

页码: 44-49

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