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刘昕 (刘昕.) | 谭建军 (谭建军.) | 陈慰祖 (陈慰祖.) | 刘斌 (刘斌.) | 李杉 (李杉.) | 王存新 (王存新.)

收录:

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摘要:

HIV整合酶可催化病毒复制周期中的整合过程,即将HIV反转录产物cDNA整合入宿主基因组,它是病毒复制过程中不可缺少的酶,也是抗HIV药物设计的重要靶点.构建嘧啶酮类(pyrimidones) HIV-1整合酶抑制剂定量构效关系模型,有助于进一步了解影响抑制剂活性的结构因素.本文应用CoMFA软件计算了68个化合物的拓扑、分子极化、亲水性等结构参数,用所选的结构参数作为支持向量机(support vector machine,SVM)的输入,建立起非线性的支持向量机回归模型.研究表明:支持向量机算法与分子结构参数的有机集成,可为HIV整合酶抑制剂的结构与活性数据建立起预测模型,为抗HIV药物设计提供生物学信息.

关键词:

HIV-1整合酶抑制剂 嘧啶酮 定量构效关系 支持向量机

作者机构:

  • [ 1 ] [刘昕]北京工业大学
  • [ 2 ] [谭建军]北京工业大学
  • [ 3 ] [陈慰祖]北京工业大学
  • [ 4 ] [刘斌]北京工业大学
  • [ 5 ] [李杉]北京工业大学
  • [ 6 ] [王存新]北京工业大学

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来源 :

北京工业大学学报

ISSN: 0254-0037

年份: 2013

期: 4

卷: 39

页码: 634-640

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