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丁程 (丁程.) | 李晓琴 (李晓琴.)

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摘要:

热稳定性相关区域的识别是蛋白耐热性改造的关键问题之一.本文以枯草杆菌蛋白(SUBTILISIN BPN(''))为研究对象,通过枯草杆菌蛋白同源家族序列的统计耦联分析,提取枯草杆菌蛋白中的保守残基和强耦联残基,并运用分子动力学模拟方法,提取枯草杆菌蛋白表面候选突变残基,综合上述结果,提出了枯草杆菌蛋白表面酎热性改造关键区域的识别方法,并利用该方法确定了枯草杆菌蛋白表面的10个耐热性改造关键区域.将该结果与已有的耐热性突变实验资料进行了对比,发现其中的7个预测区域与实验结果吻合.结果验证了该方法可以较好地识别蛋白耐热性改造关键区域.

关键词:

保守残基 分子动力学模拟 统计耦联分析 蛋白耐热性 高耦联残基

作者机构:

  • [ 1 ] [丁程]北京工业大学
  • [ 2 ] [李晓琴]北京工业大学

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来源 :

生物信息学

ISSN: 1672-5565

年份: 2013

期: 2

卷: 11

页码: 124-129

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