目的分析北京市HIV-1　B亚型的分子流行特征。方法采集北京市2006年至2010年新发现的HIV-1　B亚型感染者抗凝血,反转录套式PCR扩增病毒gag基因,并进行系统进化和Entropy核苷酸多态性差异分析。结果成功扩增167份标本,其中欧美B亚型10份,B＇亚型54份,中国B亚型101份。B＇亚型进化簇内存在多条来自泰国和印度的序列,中国B亚型独立成簇,进化簇内无其他国家的序列。中国B亚型存在4个亚簇,71.1%的病例为男男性传播。以欧美B进化簇为参照,B＇亚型和中国B亚型进化簇分别存在55和94个有明显差异的核苷酸位点。结论北京市存在3种类型的HIV-1　B亚型,其中1种为本土株。