不依赖于纯培养的分子生物技术已广泛应用于环境微生物的研究.综述了近年来在荧光原位杂交技术(Fluorescent　in　situ　hybridization,FISH)和聚合酶链式反应技术(Polymerase　chain　reaction,PCR)基础上发展起来的几种新分子生物技术的基本原理,包括FISH-MAR、FISH.microelectrodes、Clone-FISH、SIP、PCR-DGGE-cloningsequencing、PCR-T-RFLP、Real-time　fluorescent　quantitative　PCR和RT-PCR,以及其在污水生物处理系统内硝化菌群研究领域巾的应用现状.通过这些分子生物技术,可以识别污水生物处理系统内的硝化菌群;建立硝化菌群动态变化与工艺运行参数之间的相关关系;从微生物学角度对系统运行状态给予最直接、最可靠的分析与让明,为污水生物处理系统的长期稳定运行奠定理论基础.最后对该领域的未来发展进行了展望.