• 综合
  • 标题
  • 关键词
  • 摘要
  • 学者
  • 期刊-刊名
  • 期刊-ISSN
  • 会议名称
搜索

作者:

刘岳 (刘岳.) | 徐海松 (徐海松.) | 乔辉 (乔辉.) | 李晓琴 (李晓琴.)

收录:

CQVIP CSCD

摘要:

蛋白质折叠识别是蛋白质结构研究的重要内容.双绕是α/β蛋白质中结构典型的常见折叠类型.选取22个家族中序列一致性小于25%的79个典型双绕蛋白质作为训练集,以RMSD为指标进行系统聚类,并对各类建立基于结构比对的概形隐马尔科夫模型(profile-HMM).将Astral1.65中序列一致性小于95%的9 505个样本作为检验集,整体识别敏感性为 93.9%,特异性为82.1%,MCC值为0.876.结果表明:对于成员较多,无法建立统一模型的折叠类型,分类建模可以实现较高准确率的识别.

关键词:

双绕蛋白质 折叠类型识别 RMSD 系统聚类 隐马尔科夫模型

作者机构:

  • [ 1 ] [刘岳]北京工业大学
  • [ 2 ] [徐海松]北京工业大学
  • [ 3 ] [乔辉]北京工业大学
  • [ 4 ] [李晓琴]北京工业大学

通讯作者信息:

电子邮件地址:

查看成果更多字段

相关关键词:

来源 :

生物信息学

ISSN: 1672-5565

年份: 2010

期: 1

卷: 8

页码: 1-6

被引次数:

WoS核心集被引频次:

SCOPUS被引频次:

ESI高被引论文在榜: 0 展开所有

万方被引频次: 3

中文被引频次:

近30日浏览量: 2

归属院系:

在线人数/总访问数:288/5041024
地址:北京工业大学图书馆(北京市朝阳区平乐园100号 邮编:100124) 联系我们:010-67392185
版权所有:北京工业大学图书馆 站点建设与维护:北京爱琴海乐之技术有限公司