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齐立省 (齐立省.) | 陈慰祖 (陈慰祖.) | 王存新 (王存新.)

收录:

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摘要:

提出了一种以残基间距离涨落为权重的氨基酸网络的加权方式.对180个蛋白质的加权与非加权氨基酸网络的拓扑特征量进行了分析.统计结果表明,氨基酸网络具有明显的小世界特征,加权网的平均集聚系数比非加权网的小.节点度分布具有幂律形式,显示了网络的层次模块性,进一步发现疏水残基对这一性质起了主要作用.另外,加权网的介数对折叠核的区分能力强于非加权网,表明加权网较非加权网包含了更多的蛋白质结构信息.

关键词:

小世界特性 幂律分布 残基涨落 氨基酸网络

作者机构:

  • [ 1 ] [齐立省]北京工业大学
  • [ 2 ] [陈慰祖]北京工业大学
  • [ 3 ] [王存新]北京工业大学

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来源 :

北京工业大学学报

ISSN: 0254-0037

年份: 2010

期: 12

卷: 36

页码: 1695-1699

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