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王金莲 (王金莲.) | 阮晓钢 (阮晓钢.) (学者:阮晓钢) | 李晓明 (李晓明.)

收录:

CQVIP PKU CSCD

摘要:

采用生物信息学方法对肿瘤基因表达数据进行挖掘,以获取和肿瘤不同亚型相关的候选标志基因集合,应用机器学习方法从标志基因集合中提取出甄别肿瘤不同亚型的规则集,进而建立起肿瘤预测模型.利用Relief、信息增益和分类信息指数从不同角度挖掘蕴含在基因表达谱中的候选特征基因,抽取出候选特征基因公约集合.以对不同肿瘤组织样本的识别能力为依据,选取分类能力最强的一组基因集合作为特征基因.利用规则判定树提取出反映这些特征基因相互作用的规则集并以此构建肿瘤预测模型,并将此模型应用于白血病基因表达数据中,建立了白血病分子预测模型.研究表明,该模型得到的白血病标志基因对肿瘤临床诊断具有一定的参考价值.

关键词:

决策树 基因表达谱 支持向量机 肿瘤

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学电子信息与控制工程学院
  • [ 2 ] 首都医科大学生物医学工程学院
  • [ 3 ] 廊坊师范学院

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来源 :

北京工业大学学报

年份: 2009

期: 03

卷: 35

页码: 301-308

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