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作者:

孙庭广 (孙庭广.) | 刘明 (刘明.) | 陈慰祖 (陈慰祖.) | 王存新 (王存新.)

摘要:

大肠杆菌的维生素B12转运蛋白(BtuCD)属于ATP结合盒转运蛋白,目前对BtuCD转运底物进入胞质内的确切机制仍不清楚.本研究将BtuCD的跨膜结构域BtuC插入棕榈酰油酸磷脂酰胆碱(POPC)双层膜中,通过MD模拟来研究BtuC的功能性运动.通过超过57ns的MD模拟得到了稳定的蛋白质-脂双层膜体系.模拟结果发现,POPC双层膜能够调整其厚度以适应其中的BtuC.反映脂双层膜性质的两个参数,即每个脂分子的面积和脂双层膜厚度,均与实验测得数据吻合.通过对从MD模拟提取的轨迹进行主成分分析(PCA),使得能从原子水平上了解BtuC的几种主要运动模式.结果表明,尽管BtuC的几种主要运动模式各...

关键词:

BtuCD POPC脂膜 主成分分析 功能性运动

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学
  • [ 2 ] 生命科学与生物工程学院

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来源 :

中国科学(C辑:生命科学)

年份: 2009

期: 06

卷: 39

页码: 567-578

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