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李玉鑑 (李玉鑑.) | 王方圆 (王方圆.)

收录:

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摘要:

为了克服传统距离法在构建进化树时需要进行多序列比对所带来的计算复杂度问题,提出了利用两两序列之间的归一化编辑距离矩阵来构造进化树的方法.通过对11种脊椎动物和20种哺乳动物的Nd5、Nd4和Cytb的基因序列以及线粒体全基因组序列数据,分别计算归一化编辑距离矩阵,并使用Neighbor-Joining法,重建了一些已被多种方法验证过的进化树.

关键词:

计算复杂性 系统进化树 归一化编辑距离 多序列比对

作者机构:

  • [ 1 ] [李玉鑑]北京工业大学
  • [ 2 ] [王方圆]北京工业大学

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来源 :

北京工业大学学报

ISSN: 0254-0037

年份: 2008

期: 11

卷: 34

页码: 1211-1215

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