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基于MPI的分子对接并行算法
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基于消息传递接口(Message Passing Interface,MPI),用两种不同的并行程序设计方法对Autodock程序进行修改.将修改后的程序应用于HIV-1蛋白酶(Protease)和小分子抑制剂XK263的对接体系,测试了并行程序的加速比和并行效率.结果表明,两种改进的并行Autodock程序都可以很好地完成计算,尤其是方案Ⅱ并行程序的加速比和并行效率更高.
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来源 ：
计算物理
年份： 2008
期： 02
页码： 241-246
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环境与生命学部 生命科学与生物工程学院
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