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王先良 (王先良.) | 王小利 (王小利.) | 徐顺清 (徐顺清.) | 赵秀阁 (赵秀阁.) | 全占军 (全占军.) | 钱岩 (钱岩.) | 张金良 (张金良.)

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摘要:

建立一种基于甲基化特异性引物和SAGE技术的高通量DNA甲基化定量检测新方法(MSP-SAGE),首先利用亚硫酸氢钠对基因组DNA进行处理,使未甲基化的C转变为U,而甲基化的CpG不变.将处理和未处理的DNA双链变性后用随机引物PNNNNCG对存在含有CG的单链进行延伸,而无甲基化CG的单链处则不能延伸;将差异延伸的单链序列和频次信息经过系列分子操作后,引入PCR扩增模板;对中间带有未知序列的PCR扩增产物进行串连克隆测序.将来自于未处理组和处理组的某一CpG位点的序列出现的次数定义为[Tags]A和[Tags]B,将标准系列的实际甲基化水平和[Tags]B/[Tags]A之间建立线性回归方程...

关键词:

DNA甲基化 甲基化特异性引物 表观遗传学 高通量

作者机构:

  • [ 1 ] 中国环境科学研究院环境污染与健康研究室
  • [ 2 ] 北京工业大学生命科学学院
  • [ 3 ] 华中科技大学环境与健康教育部重点实验室

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来源 :

中国生物化学与分子生物学报

年份: 2008

期: 09

页码: 866-872

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