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孔韧 (孔韧.) | 徐雪梅 (徐雪梅.) | 陈慰祖 (陈慰祖.) | 王存新 (王存新.) | 胡利明 (胡利明.) (学者:胡利明)

收录:

PKU CSCD

摘要:

吡咯烷与正丁烷类CCR5(化学趋化因子受体5)拮抗剂可通过抑制人类免疫缺陷病毒(HIV-1)包膜蛋白与CCR5的相互作用而阻断病毒进入细胞.本文使用已知拮抗剂结构和活性信息构建了一个三维药效团模型.按照Catalyst/HypoGen模块的要求,选择了25个结构和活性均具备差异性的分子作为药效团产生的训练集.其中训练集分子以IC_(50)值表示的生物活性值跨度为0.06到10000 nmol·L~(-1).最好的药效团模型(Hypo 1)由两个正离子化特征以及三个疏水特征组成,训练集预测相关系数为0.924,均方根偏差为1.068.模型用于预测由74个分子组成的测试集化合物活性,结果表明模型可...

关键词:

CCR5 HIV-1 基于配体的药物设计 药效团模型

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学生命科学与生物工程学院
  • [ 2 ] 北京工业大学生命科学与生物工程学院 北京 100022
  • [ 3 ] 北京 100022

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来源 :

物理化学学报

年份: 2007

期: 09

页码: 1325-1331

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