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阮晓钢 (阮晓钢.) (学者:阮晓钢) | 李颖新 (李颖新.) | 李建更 (李建更.) | 龚道雄 (龚道雄.) | 王金莲 (王金莲.)

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摘要:

基于肿瘤基因表达谱,利用生物信息学的方法,从肿瘤与正常组织的样本分类入手就肿瘤特异表达基因的发现及其表达模式问题进行了分析和研究,进而探讨了肿瘤在基因表达上的特点.首先,在分析肿瘤基因表达谱特点的基础上,提出了基于Relief算法的样本分类特征基因选取策略;然后,以支持向量机为分类工具进行样本类型的识别,以分类错误率为标准选取样本分类特征基因,并对其中反映肿瘤与正常样本组织构成特点的组织特异表达基因进行排除以突出肿瘤样本真实的类别特征;最后结合统计学方法,从信息学的角度论证了分类特征基因在肿瘤组织中特异表达的确实性和普遍性,并对这些基因在肿瘤组织中呈现出的特异的表达模式进行了分析.

关键词:

基因表达谱 支持向量机 特征基因选取 肿瘤

作者机构:

  • [ 1 ] [阮晓钢]北京工业大学
  • [ 2 ] [李颖新]北京工业大学
  • [ 3 ] [李建更]北京工业大学
  • [ 4 ] [龚道雄]北京工业大学
  • [ 5 ] [王金莲]北京工业大学

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来源 :

中国科学C辑

ISSN: 1006-9259

年份: 2006

期: 1

卷: 36

页码: 86-96

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