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卢本卓 (卢本卓.) | 陈慰祖 (陈慰祖.) | 王存新 (王存新.)

收录:

CQVIP PKU CSCD

摘要:

提出了将水化力加到广义Langevin方程中的新的模拟方法(GLDBEM).水化力通过边界元方法 (BEM)求出,包括溶质分子与表面诱导电荷的Coulomb相互作用和溶剂对分子表面的压力,摩擦记忆函数采用指数模型.以环苞霉素A(CPA)为研究对象,并将GLDBEM模拟结果与分子动力学(MD)模拟和通常的随机动力学(SD)模拟结果作了比较.结果表明GLDBEM模拟方法对研究分子的结构和动力学性质均比SD模拟有明显改善.

关键词:

广义Langevin动力学 摩擦记忆函数 溶剂平均力势 边界元法

作者机构:

  • [ 1 ] [卢本卓]北京工业大学
  • [ 2 ] [陈慰祖]北京工业大学
  • [ 3 ] [王存新]北京工业大学

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科学通报

ISSN: 0023-074X

年份: 2000

期: 14

卷: 45

页码: 1482-1486

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