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用MNDO方法对磷酰化丝氨酸仿生化反应机理中六配位磷中间体的形成过程进行了研究. 磷酰化丝氨酸(1)形成分子内磷酸-羧酸分子内混酐的五配位磷中间体(2)后, 其酸性质子解离, 分子经过具有氢桥键结构的过渡态, 使氨基酸侧链羟基上的氢通过氢键作用向磷上的O1进行转移, 然后再经过构型由三角双锥向八面体的转变, 形成六配位磷中间体(3). 氢桥键的存在使反应过渡态能量降低, 其相对能量为148.5 kJ/mol.理论计算较成功的解释了六配位磷中间体的形成机理以及磷酰化丝氨酸仿生化反应中羧基和侧链羟基共同参与的实验结果.
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