采用AM1半经验量化方法计算了环境污染物1,3-丁二烯代谢产物在DNA大沟侧与碱基烷化股间交联反应,结果表明:其主要代谢产物1,2-环氧-3,4-丁烯(EB)和1,2,3,4-二环氧丁烷(DEB)与腺嘌呤和胞嘧啶发生烷化反应的活性差别不大,难以用其反应活性解释其致癌活性的巨大差异;同时得到DEB发生一次烷化反应后,更易于发生第二次烷化反应,产生交联作用.这可能为两者基因毒性差异巨大的分子机制.DEB能与多种不同序列的DNA形成股间交联,有些产物互补碱对变形较大,但DNA基本结构仍保持;对比在小沟测DEB只易与两种不同序列的DNA形成股间交联,且交联结构变形很小.此发生股间交联的几率差异和结构变形差异可能为DEB基因毒性的碱基序列选择性的内在原因.