在科学计算、数值模拟等领域，短时间内会产生海量的教据，传统处理数据的软件都基于串行算法，效率低下，不能满足大规模数据及时、高效处理的要求。并行计算在各个领域的应用也越来越广泛。并行编程框架Hadoop在实际应用中效果显著，微软最新的并行编程框架DryadLINQ也逐渐得到推广。基于Windows　HPC　Server2008　R2集群系统比较分析Hadoop并行编程框架和DryadLINQ并行编程框架，分别使用这两种框架进行编程对大规模结构工程试验数据进行快速傅里叶变换，以测试Hadoop和DryadLINQ并行处理数据的性能和效率。