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刘晓辉 (刘晓辉.) | 李晓琴 (李晓琴.) | 任文科 (任文科.) | 徐海松 (徐海松.)

摘要:

本文发展了BLOSUM矩阵,定义了基于蛋白质折叠类型的序列-结构数据块,提出一种新的基于蛋白质折叠类型的氨基酸残基相互作用取代矩阵——TOPSSUM25,将矩阵TOPSSUM25导入多序列比对程序,对相似性小于25%的一组四螺旋束序列-结构数据块进行处理,发现基于TOPSSUM25矩阵的多序列比对效果明显优于BLOSUM矩阵,结果为进一步研究低同源蛋白质序列-结构-功能关系提供帮助。

关键词:

低同源性 取代矩阵 多序列比对 折叠类型 蛋白质结构

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学生命学院

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来源 :

年份: 2007

语种: 中文

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