目的研究HIV-1整合酶(IN)与已知抑制剂硫氮硫扎平类的结合模式、结合强度,为寻找具有更好活性的抗HIV药物提供帮助。方法用同源模建方法搭建每条单链核心区具有两个Mg2+的IN二聚体模型。分子对接搜索能量较低的硫氮硫扎平类化合物-IN对接复合物,并对复合物进行了分子动力学模拟。结果得到了每条单链核心区具有两个Mg2+的IN二聚体模型。得到了能量较低的多个硫氮硫扎平类化合物-IN对接复合物。发现这些构象具有很强的相似性,硫氮硫扎平类化合物具有很强的结合专一性。对于构象的研究发现,氮硫扎平类化合物与IN活性位点的一些氨基酸有极重要的相互作用。结论建立的模型能够有效地反映HIV-1IN与硫氮硫扎平...