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作者:

尚文慧 (尚文慧.) | 王晓曦 (王晓曦.) | 李晓琴 (李晓琴.) | 高斌 (高斌.)

摘要:

选取癌症基因组图谱数据库的肺鳞状细胞癌(Lung Squamous Cell Carcinoma,LUSC)样本作为数据集,在全基因组的水平上研究肺鳞状细胞癌病人从正常到发病I期基因表达的变化,寻找与LUSC发病密切相关的早期标志物,并建立一种基于早期标志基因的肿瘤预测模型。方法采用模式识别分类法和基因通路和功能分析相结合的筛选方法,对LUSC的早期标志物进行识别,并运用Fisher判别建立肿瘤预测模型。得到12个LUSC的早期标志物,分别是CLDN18,CD34,ESAM,JAM2,CDH5,F11,F8,CFD,MRC1,MARCO,SFTPA2和SFTPA1,机器学习建模后对LUSC早期...

关键词:

基因表达 早期标志物 肺鳞状细胞癌 肿瘤发生 诊断模型

作者机构:

  • [ 1 ] 北京工业大学生命科学与生物工程学院

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来源 :

生物信息学

年份: 2020

期: 04

卷: 18

页码: 223-235

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