一种基于双聚磷菌协同作用强化生物除磷的装置与方法，属于污水生物处理技术领域。所述装置包括进水箱、生物除磷反应器、蠕动泵、储泥罐、空气泵。所述方法是将剩余污泥当作基质，与废水一起进入生物除磷反应器，在厌氧阶段具有发酵能力的聚磷菌Tetrasphaera利用剩余污泥作为基质，产生挥发性脂肪酸VFA供给传统聚磷菌Candidatus　Accumulibacter利用，存储内碳源并释放磷酸盐；在好氧段聚磷菌Tetrasphaera和Candidatus　Accumulibacter可以共同过量吸收污水中的磷酸盐，实现协同除磷。利用双聚磷菌的协同作用，可以减少对进水VFA的依赖，同时在好氧段二者共同吸磷，可以有效强化生物除磷，对于很多地区碳源匮乏污水的处理提供了一个崭新的工艺解决方案。