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一种旁侧富集聚糖菌的控制方法，属于污水生物处理领域。通过控制第一序批式反应器排入至旁侧处理序批式反应器中的泥水混合物量，实现第一序批式反应器正常运行以及控制旁侧处理反应器的处理负荷；通过控制旁侧处理序批式反应器的水力停留时间以及旁侧处理时间来控制聚糖菌的富集效果；通过控制旁侧处理次数来控制第一序批式反应器内聚糖菌的富集程度。旁侧处理序批式反应器运行时泵入配水水箱中不含磷的配水，通过碳源加药器投加碳源，厌氧末排出富磷上清液后重新泵入配水，进入好氧阶段，从而富集聚糖菌，抑制聚磷菌。重复处理多个周期后，将污泥重新泵入第一序批式反应器，完成一次完整的旁侧处理。重复旁侧处理，实现主反应器内聚糖菌的富集。
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