以2013-2018年中关村国家自主创新示范区科创企业为样本,基于“双创”政策实施设计自然实验克服内生性问题,并按照企业规模分组来考察科创企业融资模式对企业创新产出的影响.研究发现:股权融资模式对于科创企业来说最为重要,其余依次为内源融资、银行贷款,　“双创”政策实施后企业股权融资所占比重进一步提高,内源融资所占比重逐年下降,表明我国科创企业存在一定的过度投资现象;内源融资和银行贷款对科创企业的创新产出具有促进效应,而股权融资由于会使企业控制权分散、核心科技人员创新热情减弱等而抑制企业的创新产出,特别是对于规模较小的科创企业,企业创新产出受不同融资模式的影响更为显著;“双创”政策实施显著降低小型科创企业内源融资、银行贷款、股权融资对企业创新产出的影响.研究得到主要启示如下:政府相关部门应帮助企业完善公司治理、调整融资决策,并进一步完善资本市场体系及相关制度,鼓励科创企业执行双重股权制度;进一步完善小型科创企业管理制度、提高企业规范化程度,并进一步改善企业的创新环境.