本发明提供一种北斗与GPS混合系统数据的识别接收算法，包括下述步骤：首先，双模定位控制模块U2询问数据处理模块U3是否空闲，若是，则发出接收卫星数据的控制命令，使得数据处理模块U3接收卫星数据并输出；然后，对于数据处理模块U3输出的卫星数据，常规协议帧处理模块U4、$GNGSA协议帧处理模块U5、$**GSV协议帧处理模块U6分别进行识别处理。常规协议帧处理模块U4识别并接收$GNGGA协议帧、$GNGLL协议帧、$GNRMC协议帧；$GNGSA协议帧处理模块U5识别出分属于北斗系统的$GNGSA协议帧和GPS系统的$GNGSA协议帧并接收。$**GSV协议帧处理模块U6识别出$GPGSV协议帧和$BDGSV协议帧并接收。本发明用于双模系统下协议帧的区分。