本发明公开了序批式反应器快速提高氨氧化菌富集速率和程度的方法。本发明在序批式反应器(SBR)中采用活性污泥法处理含氨氮废水，以ORP的移动斜率(MSC)作为氨氧化过程的指示参数，提高氨氧化菌富集速率；通过先逐渐提高进水氨氮浓度培养硝化细菌活性，再利用高游离氨(50～65mg　NH3/L)、高游离亚硝酸(2～8mgHNO2-N/L)和适量排泥将亚硝态氮氧化菌和异养菌淘洗出系统，提高氨氧化菌富集程度。实现序批式反应器氨氧化菌富集速率和程度的快速提高。氨氧化菌富集反应器可在40天左右将氨氧化菌占细菌总数比例由3%提高到11%，第100天左右提高到90%，污泥负荷可达1.31kgNH4+-N/(gvss·d)。本发明具有氨氧化菌富集时间短、氨氧化菌富集程度高、控制灵活等优点。