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本发明属于数据挖掘领域，公开了一种针对多视图数据融合的蛋白质功能模块挖掘方法。首先，量化多个数据源对蛋白质相互作用的强弱描述，形成多视图数据；进而，利用本发明提出的聚合非负矩阵算法对多视图数据进行一致矩阵分解，通过得到对多视图信息的最优近似，确定蛋白质的功能模块。本发明提出一种针对多视图数据融合的蛋白质功能模块挖掘方法，着眼于同时分析多生物数据，包括基因共表达、GO注释和PPIN，从多视图中提取聚合特征最为一致的蛋白质功能模块。本发明尤其适用于蛋白质相互作用网络和生物数据，同时可应用于社交复杂网络、通讯网络的社区挖掘问题。
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